Timoteo II di Alessandria fu un monaco e patriarca del V secolo che servì come leader della fazione miafisita in Egitto. Conosciuto anche come Timoteo Ailuro, fu eletto alla sede di Alessandria nel 454 in seguito all'esilio di Dioscoro. La sua leadership fu caratterizzata da intensi conflitti teologici con l'establishment pro-calcedoniano, che portarono alla sua temporanea espulsione da parte dell'imperatore Leone I nel 460. Alla fine tornò alla sua carica nel 475 e rimase patriarca fino alla sua morte nel 477.